你好！就你说的情况而言，你可以申请仲裁要求公司向你支付工资差额，只要你有证据证明公司少发了工资，那么公司就有义务就其少发工资作出说明，并应提供相应的证据和依据。如依据不充分，将按克扣工资认定。至于加班工资，可以在申请仲裁时一并主张，但需要你提供加班事实存在的证据。简单来说，劳动者主张加班工资，负有提供证据证明加班事实存在的举证义务。